Alnio,
Os professores substitutos possuem matrícula SIAPE.
Então o procedimento correto a seguido na Criação de Turma/Atendimento de Solicitação é a Chefia deixar a turma temporariamente sem professor.
A turma ficará com a opção "A DEFINIR DOCENTE".
Posteriormente, a chefia de departamento poderá associar o docente recém-admitido à turma, tão logo já tenha sido criada a SIAPE para o mesmo.